鳌拜被捕后，皇帝下诏朝廷内外，列举了鳌拜结党专权、不尊君上、行私纳贿等三十条罪状。根据鳌拜的罪状应该以极刑处死，但康熙帝考虑他多年为皇室效力，不忍心将他处死，只将他革去一切职务、没收家产，监禁起来，不久死于狱中。

康熙五十二年，康熙皇帝想到鳌拜过去的功劳，追赐他一等阿思哈尼哈番的世袭爵位，让他的弟弟巴哈的孙子苏赫承袭，苏赫死让他的孙子达福袭爵。雍正时期，世宗恢复鳌拜一等公世袭，加封号“超武”，纪念他在大宗、世祖朝代的武功。

乾隆四十五年(1780)，清高宗对鳖拜的功罪重加评定，令其后代停止世袭一等公爵，但仍给世袭一等男的荣誉和待遇。 综观鳌拜一生，不失为清朝前期有功臣至权臣的名臣。他在太宗、世祖两朝立下无数战功，在福临继承皇位的斗争中起了重要作用，多尔衮摄政时鳌拜身处逆境不屈服，辅政初期多有建树，对巩固清朝统治和全国的统一是有重要贡献的。辅政后期失误较多，以后为康熙皇帝及时纠正。