湘军将领对军中哥老会并不是没有整治、肃清，早在1859年，曾国藩制定湘军营规时，就提到“禁止结盟拜会：兵勇结盟拜会，鼓众挟制者严究;结拜哥老会，传习邪教者斩!”次年，左宗棠在长沙编练新勇，将勇丁结拜哥老会列为“行军五禁”。可见，湘军将领深刻意识到军队被黑社会侵染的危害，也采取了必要措施来防范。但成效并不理想。军队黑社会化之势已逐渐蔓延，一些统领为了方便带队伍，也加入哥老会，有军官和黑社会老大的双重身份，江湖中的种种弊病就像草树遇到沃土迅猛生长，闹出种种骚乱、哗变并不为奇。

　　有人说，曾国藩裁撤湘军是为了向清廷表忠心，自己并没有打算手握一支庞大的私人武装，因之并无意对抗朝廷。这确实没错，曾国藩并不打算凭借私人武装向清廷叫板，且对于曾国藩来说，另外两个现实或许更为紧迫：一是湘军赖以生存的后方基地湖南财力匮竭，无钱养兵，必然导致士兵索饷哗变、扰民乱世，曾国藩好不容易积累的政治地位必然难保;二是此时的湘军受哥老会多年浸淫，已经严重黑社会化，弊病重重，难堪重用。在这种情况下，“裁一勇即节一勇之靡费，亦即销无穷之后患”。

　　1866年，曾国藩写信给朋友陈鼐说：“幸鄙人见机尚早……两年间，湘勇遣撤将毕，幸全体面，差强人意。否则变端尚多，岂仅微防之闹，成部之叛哉!”曾国藩主动裁撤湘军，在客观上形成了功成身退、避免疑忌的效果，受到清廷赞赏，收获了“立功、立德、立言”的圆满人生。

　　湘军是裁撤了，但哥老会仍在，并影响着中国近代历史进程。譬如辛亥革命爆发的导火索四川保路运动，哥老会就是抗击清军的重要力量，对保路成功起到关键作用。又譬如民国时期，哥老会在川内迅速繁衍，大军阀刘文辉就是袍哥头目，邓锡侯、刘湘、杨森等军阀中，哥老会占绝大多数。有统计称，川军总数中，参加袍哥的占60%。军队黑社会化造成军阀混战，四川连年动荡不安，从1921年至1933年，四川发生了大小战争479次，平均每年达20次以上。

　　而清末的湘军与淮军，对此后中国政治、军事格局的影响同样深远。有学者就认为，湘、淮军在镇压太平、捻军之后，一部分军队裁撤，大部分留驻各地成为防军，并逐步取代原有的八旗、绿营而成为清朝的常制军队。随此而出现的，是湘、淮军集团控制了全国许多省区地方政府的实权。清朝末年，湘、淮两个集团，分别长期盘踞了两江总督兼南洋大臣、直隶总督兼北洋大臣的重要职位，形成相当大的地方势力。而后来袁世凯的新建陆军，正是继承了湘、淮军衣钵，并在此基础上发展成为祸国殃民的北洋军阀集团。