曹操杀华佗，似乎自断后路，所以后人多有疑者。《三国演义》的作者，是反曹派的大将，他写到曹操的儿子及自己生病，悔杀华佗时，得意之色，纸不能掩。不过我们知道，《三国演义》里的许多故事都是杜撰的，比如关羽刮骨疗毒，这个事是有的，但不是华佗所为。

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　　古时，医人不为时所重，著名的张仲景，在正史中就无传，华佗有传，却在《后汉书》的《方术传》，及《三国志》的《方伎传》中。欲为名医，得给名人看过病，张仲景医中亚圣，而且做过太守，但论政事，他大概没什么可传的，论医术，他诊治过的最有名的人，不过是文人王粲，所以百代医师，史竟无传。华佗给曹操、司马懿看过病，得入《方术传》，已经算幸运了。

　　华佗被曹操召至身边，身份是术士。曹操前期，对道术在半信半疑间。除华佗外，魔术家左慈，通房中术的甘始，能藏在壶里的费长房，会辟谷的郗俭，身子能发光的东郭延年，他都罗致到都中，既是好奇，也是防范这些人在外面生事。华佗医术虽高，在曹操看来，大概也是方士者流，并不真正看重。把华佗下狱时，也有人劝他，说华佗的医术着实不错，人命所系，应该宽宥。曹操说:“不忧，天下当无此鼠辈耶?”