作为曾经亲随拿破仑参加了所有意大利战役高级军事智囊，拿破仑本人对贝尔蒂埃的评价非常高。后人曾在拿破仑的作战日志中读到过有关高度赞誉贝尔蒂埃“工作非常积极，具有一个优秀军事参谋长的一切素质”的记述，这也进一步证实了人们关于拿破仑在军事行动中重视并依赖贝尔蒂埃的猜测，甚至可以说，拿破仑所总结的这一切，也代表了当时法军许多高级将领对贝尔蒂埃的评价。

至于谴责其为“蹩脚指挥官”的说法，大约要从1809年，奥军入侵法国的盟友巴伐利亚时，贝尔蒂埃的作战表现说起。

1809年，战役发生之时，贝尔蒂埃在拿破仑不在的情况下，临时代理大军团司令，指挥前沿作战。军事参谋长出身的贝尔蒂埃在面对突如其来的战况时，明显表现出惊慌失措和经验不足，在指挥中做出了错误的判断，手忙脚乱中延误了战机，致使法军在尚未交战之时，气势上先输了一筹。

在贝尔蒂埃仓皇的指挥下，法军兵力部署过于分散，从而给了敌人可乘之机。在接下来的城防战中，法军的整体战斗力明显下降，幸而拿破仑率领援军及时赶到，才为贝尔蒂埃大军解了困。巴伐利亚一战，亦成为贝尔蒂埃辉煌战争史中的一大败笔。