爱因斯坦的相对论包括广义相对论和狭义相对论，当然他的相对论懂的人实在是少，所以要回答爱因斯坦的相对论是什么这一类的问题是比较困难的。除了相对论之外，爱因斯坦其实还提出了其他的理论，比如质能方程，本文也会简单介绍一下。

　　爱因斯坦的狭义相对论是什么
　　1916年，爱因斯坦的广义相对论刚提出来的时候，有一个说法是：“全世界只有三个人懂！”注意这句话说的是广义相对论，而不是狭义相对论。当然这句话也是随便说说的，懂广义相对论的人确实不多，爱因斯坦肯定懂，比如德西特也懂一些，爱丁顿也能懂一些，剩下的希尔伯特与史瓦西也能懂其中的数学部分，虽然物理部分不是太懂。但过了几年，懂广义相对论的人就多了。
　　而1905年爱因斯坦提出狭义相对论的时候，懂的人肯定比较多，除了洛仑兹和庞加莱本来就做过类似的数学工作，普朗克的学生劳厄与爱因斯坦聊了以后，也懂了狭义相对论——并且写了一本狭义相对论的教材。因为狭义相对论的数学是中学生水平，所以大家学习起来没什么难度，只要放弃了绝对静止的惯性参考系，再加上接受光速不变的假设，基本上是可以理解整个理论的。
　　至于你提到的近光速飞船上的时钟，那上面的时钟确实是会相对地球变慢的，至于为什么变慢，其实也很简单，因为一个从地球上出发的飞船，必须要不断加速才能达到接近光速。在这个加速过程中，消耗了很多能量——所以，近光速飞船上的时钟确实是会相对地球变慢，否则这些能量消耗后没有产生什么可观测的效果，钱就白花了。
　　质能方程是爱因斯坦提出来的吗
　　质能方程是爱因斯坦提出的。那是爱因斯坦1905年所发表的5篇划时代论文之一。那年年初，爱因斯坦给朋友的信中提到了他计划中的这5篇论文，其中谈到这篇文章时，它说：“相对论原理与麦克斯韦方程结合，要求物体的质量是它所包含的能量的一个直接量度。在镭的情形，有可观的质量减少。推论过程很有趣、有吸引力，但是在我看来，上帝可能在笑而牵着我的鼻子。”
　　爱因斯坦的推导如下。 他考虑某个物体发出光，从而放出能量。在物体本身的参照系以及相对于它作匀速运动的参照系中测得的光的能量相差一个洛伦兹因子。这个差别正好与两个参照系中动能之差一样。爱因斯坦由此得出结论，如果物体发出辐射能L，质量就减少L除以光速的平方。
　　爱因斯坦当时就将此结论与放射性的镭相联系。1907年，普朗克估算了与分子结合能相应的质量只是10的-8次方克。1930年代，人们开始讨论原子核的结合能与质能方程的关系。1937年，人们甚至可以从核反应的初始和终末的质量来计算光速。
　　1907年，爱因斯坦就带有预言性地说过：“有可能将来人们会发现这样的发射性过程，它的初始原子的质量的一部分转化为各种辐射，能量占初始质量的比例比镭的情形大得多。”不知道他从西拉德那里了解导核裂变时，有没有想到自己以前的这段话。