后来由刘秀主导的南阳地主集团也和赤眉军有了很大的矛盾，在于赤眉军对抗多时之后，刘秀在洛阳建立了都城，赤眉军在湖城作战胜利之后，没有注意调理自己的部队，粮食也很缺乏，最后被刘秀的军队围攻，又饿又疲惫的赤眉军最后招架不住，只好败下阵来。