1585年，进行四国征伐，降服长宗我部氏，同年降服越中国佐佐成政，就任关白。

天正13年（1585年），秀吉派遣其弟秀长、小早川隆景等将领攻打刚统一四国的长宗我部氏，利用兵力的差距迫使其归降并仅保有土佐一国，另外秀吉派遣藤堂高虎为首的部队，平定了杂贺众，首领铃木重意被斩首处死。

此外，秀吉派重兵攻打越中国佐佐成政，开战派大军包围，成政不战而降，同年秀吉希望成为征夷大将军，但在公卿的劝阻下转而向朝廷索取关白的封号，为此秀吉一度打算认前关白近卫前久为义父，得到“近卫”姓氏（因为日本有关白只能由出自藤原一族的近卫、鹰司、一条、二条、九条等“五摄家”世袭的传统）。

1585年7月11日朝廷允其成为前久的犹子并就任关白，并应其要求赐予新的姓氏“丰臣”。

1586年9月9日，“丰臣”也由此成为继“藤原”、“源”、“平”、“橘”等四大姓氏之后的第五大姓氏，不过“丰臣”未能象其余四大姓那样发扬光大，因为它只传了两代就绝嗣了，在得到“丰臣”之姓，改名丰臣秀吉。

1586年秀吉将其妹旭姬嫁与德川家康，作为家康正室，将自己的母亲大政所送回家康身边成为人质，德川家康此后臣从秀吉，1586年12月25日就任太政大臣，同年，九州大名大友宗麟向秀吉请求支援。

1587年，进行九州征伐，派遣秀长率领大军攻击岛津氏的支城，降服岛津氏，战后岛津氏被分配到萨摩和大隅两国，同年禁止基督教。

1588年秀吉开始实行“刀狩令”，加强了兵农分离的政策。

1589-1590年，发动小田原之战，灭后北条氏，基本上统一日本。

1589年后北条氏的家臣猪俣邦宪夺取了真田昌幸管辖下名胡桃城，导致秀吉下令全日本大名讨伐后北条氏，不服从者将会受到失去领土的处分，秀吉率20万大军向后北条氏攻击，攻陷北条各个支城，逐渐向小田原城包围。

7月北条氏政、氏直父子开城投降，氏政、氏照两兄弟切腹自尽，氏直被流放到高野山，战后秀吉为各大名分封新的领土。

1591年，将关白之位让给外甥丰臣秀次，自称太阁（前关白的尊称）。

1591年秀吉进行他人生中最后一场日本国内战争——平定九户政实之乱，派遣了蒲生氏乡、浅野长政及石田三成联同东北地方大名平定九户政实之乱，同年，秀吉命令茶人千利休切腹自尽，原因不明。

6、丰臣秀吉晚年征伐朝鲜

丰臣秀吉统一日本后，治国有方，多年战乱的日本一时间国泰民安，他见日本已经安定，遂萌发了建立一个亚洲大帝国，他决心到比日本更广大的空间施展一番。

首先要征服朝鲜，再来征服中国，后再征服印度，建立一个包括日本中国、印度、朝鲜在内的亚洲大帝国。

1592年，秀吉出兵率兵20万征伐朝鲜，兵员以西日本诸大名为主，此战日本称为“文禄庆长之役”（因当时年号之故），朝鲜称“壬辰卫国战争”（因1592年为壬辰年之故），中国称“万历朝鲜战争”（因当时年号之故）。

1598年9月18日，丰臣秀吉逝世于伏见城，享年62岁。