这一段公案，到了明史专家吴晗那里，有了新的结论，吴晗经过多方考证，得出的结论是：“刘基被毒，出于明太祖之阴谋。胡惟庸旧与刘基有恨，不自觉地被明太祖所利用。”

　　这一大胆的提法，试想一下，那么多功臣都被朱元璋杀掉了，他能放得过刘基吗?想来他欲杀刘基之心早就有了，只是没找到适当的借口。恰好胡惟庸与刘基有过节，欲治罪于刘基，朱元璋便决定借胡惟庸之手杀掉刘基。

　　刘基对官场的水深水浅早已心知肚明，也懂得树大招风、官大招祸的道理，所以一直想仿效汉朝的张良，功成身退，归隐山林，远离风暴的中心，做个逍遥达人。可是，这一简单的愿望他竟无法实现，最终还是落得个被毒死的下场。

　　其实，即使没有胡惟庸的加害，刘基也不可能得善终，因为朱元璋总会找到除掉他的借口!这是造成刘基人生悲剧的客观原因，如果从刘基自身找原因的话，是儒家那种兼济天下的思想害了他，中国的传统知识分子，不满足于只是谈诗论文，不想只做一个纯粹意义上的知识分子，总想着“学成文武艺，卖与帝王家”，怀揣经天纬地的理想，欲拯救苍生于水火，实现自己的政治抱负。

　　何乔远曾在《名山藏》一书中记述了这样一个细节：“基决计趋建康，众疑未决，基母富氏曰：‘自古衰乱之世不辅真主，讵归万全哉?’”认为在乱世从政，很难有好的下场。可惜的是，刘基没有听从母亲的意见，执意要出山辅佐明君圣主，结果被富氏不幸而言中。刘基终究没能成为张良第二，尽管再三逃避，但还是难逃宿命的结局。

　　这既是他本人的悲剧，也是那个时代的悲剧，是在那样一个皇权专制的权力结构下，他怎么也躲不开的宿命。

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