提起光绪帝的病情，还必须考虑到精神因素。他一生感情失落，政治失意，心情压抑。尤其是戊戌政变以来，他处于被软禁状态，备受凌辱和虐待，孤立无助，坐以待毙，担惊受怕，珍妃之死的消息也足以令他精神崩溃，这样一来，就没有康复的希望了。

　　据清宫脉案记载，从光绪三十四年(1908)初夏起，光绪帝病情迅速恶化，御医和全国各地应召前来的名医均感束手无策，只能不求有功但求无过地敷衍着。这年的九月中旬，达赖喇嘛从西藏来到北京，光绪帝拖着病弱的身体，连续接见、宴请，为此劳累过度。这时候慈禧也病倒了，她患的是腹泻，已经治疗了一段时间，未见明显起色，但一开始御医并未过于悲观。

　　挨过了十月初十日慈禧太后的生日，光绪帝身体机能迅速衰竭，病入膏肓。他自述有便秘、咳喘、腿酸、失眠、发热、身痛等症状。十六日，光绪帝跟慈禧太后最后一次召见大臣，他有气无力地斜倚在宝座上，身后垫满了枕头。据大臣回忆，光绪帝说话声音极小，只有简短的几句，慈禧也是一脸病态。从此，光绪帝再没有离开病榻，十九日起，已经不进食了，很快陷入昏迷。据清政府官方宣布：光绪三十四年十月二十一日(1908年11月14日)傍晚，光绪皇帝在中南海瀛台的涵元殿逝世，终年三十八岁。

　　据《清德宗实录》记载，在光绪帝逝世的前一天，慈禧授予光绪帝同父异母弟弟醇亲王载沣“摄政王”的职位，将他的长子溥仪接到宫中教养。光绪帝咽气后，慈禧立即宣布：溥仪继承同治皇帝，兼祧光绪皇帝，为清朝新一代君主。又规定：“嗣皇帝尚在冲龄，正宜专心典学。着摄政王载沣为监国，所有军国政事，悉秉承予之训示裁度施行。”这表明溥仪为帝，载沣摄政。实际上他们全是慈禧的傀儡，清朝的命脉还是掌握在慈禧手中。可见，直到此时慈禧不仅对自己的生命力依然乐观，权力欲也没有丝毫的衰减。

　　然而，在慈禧做出这一系列决定的第二天，她就走到了自己生命的尽头。光绪三十四年十月二十二日午后，慈禧太后去世，终年七十四岁。

　　噩耗公布，天下震动。为什么年轻的光绪反而死在了慈禧之前?而且，母子二人相差不过二十个小时相继去世，世界上有这么蹊跷的事儿吗?事情的真相到底是怎样的呢?

　　清史疑案，死因为何

　　近百年来，光绪皇帝的死因有两种说法：一是谋杀说;二是正常死亡说。

　　长期以来，中国史学界的主流意见倾向光绪帝死于谋杀。人们普遍怀疑慈禧及其帮凶害怕光绪帝在慈禧死后掌握政权，重翻前案，为此痛下杀手。百年间这类猜测不胫而走，广为流传。谋杀的嫌疑人有慈禧太后、袁世凯、李莲英、崔玉贵等。

　　清朝在皇帝的饮食安全、医疗保健方面有一套极为严格的制度，袁世凯身为大臣，无法接近皇帝，没有下手的机会，他若起意谋杀，只能买通太监下手。李莲英和崔玉贵身为太监，但如果不奉旨意，也难以接近皇帝;更何况李莲英缺乏谋杀的动机，他平素对光绪帝多有关照，光绪帝曾说过“若无李俺答，我活不到今日”这样的话，可见，即使光绪帝上台执政重翻旧案也跟李莲英无关，所以，他作案的可能性不大。

　　其实，光绪帝若死于谋杀，主谋元凶基本可以断定是慈禧太后，因为按常情推断，若没有她的指使，一般人不仅没有条件，也没有胆量下这种毒手。执行者很可能是崔玉贵等一帮太监，因为在庚子年间崔玉贵就奉旨杀了珍妃，以此类推，他无疑嫌疑最大。但应该强调，谋杀说属于推断，并无过硬的证据做支撑，是一种基于情理和既往事实做出的自圆其说的猜测。

　　上世纪八十年代初，“谋杀说”被推翻，光绪帝的死因被学者们定论为“正常死亡”。原来，在清宫档案中，光绪帝的脉案保存得相当完整，史学家会同中医专家系统深入地研究了这些脉案，认为符合病情演进的规律，未见特殊异常症状出现，应为心肺功能的慢性衰竭合并急性感染死亡，并无中毒和其他伤害的征象。这一说法较为广泛地被史学界认同。