康熙十二年，康熙派遣重兵分别从蜀、黔、桂三路进攻云南，吴世璠危急之下，命人火烧丛林制止清军入滇，却仍未阻止其攻势，前线败退。清军直逼省城昆明，吴世璠调兵回援，坚守五华山，病死抵抗，昆明城下，两军相持不下。这般局势维持了数月，城内粮草殆尽，城内将领皆无心抗战，望战事早早了解，将士皆有投降之心，吴世璠军队内部有间隙告知清军将领城中情况以难坚持，清军遂一鼓作气，攻下昆明城。吴世璠悬梁自尽，其妻郭皇后亦跟随自缢，其余六千多残部皆投降清军，军将领将吴世璠首级押解回京。自此，历史八年的三藩之乱正式结束。

吴三桂戎马一生，却并未其后世带来荣华富贵，相反人人安危不能自保，落得家门被灭、或隐姓埋名的下场。