傅善祥结局有三个版本，这三个版本也是人们对傅善祥的去留成谜的一种解释。

一种说法是傅善祥在太平天国起义的内部斗争中，东王杨秀清被韦昌辉率领军队联合燕王秦日纲将杨秀清的东王府杀了个鸡犬不留，傅善祥也在乱军之中被杀死了，尸体被扔进了大江中，一代才女香消玉殒。

一种说法是傅善祥在天京事变之后，逃出了对东王府的屠杀之中，并且招揽东王旧部，与翼王石达开联合起来攻打北王府，要为杨秀清复仇。

一种说法是在天京事变中，没有被杀，而是被关押了，之后在洪宣娇的营救下被救出，并嫁给了谭绍光，而谭绍光最后也被害身亡，消息传回家中，傅善祥忧郁而亡。

其中第三种说法比较可能性比较大，毕竟傅善祥在洪秀全那里也是有一号的，帮助洪秀全处理了很多政务，得到了洪秀全的认可，很可能是洪秀全授意韦昌辉不要杀傅善祥，后来洪秀全在韦昌辉杀了杨秀清之后开始反过来杀韦昌辉，韦昌辉被杀了，傅善祥自然就活了。至于说为杨秀清复仇我认为是不可能的，傅善祥在杨秀清的眼中在后期已经不是那么重要了，只是一个玩偶，聪明的傅善祥怎么会不明白这个道理，因此，她是不会为杨秀清复仇的。第一种可能性也是有的，毕竟在乱军中被杀也是有很大几率的，不过傅善祥作为杨秀清的女人毕竟不是冲锋陷阵的第一线，因此她如果得到了洪秀全的关照被杀的可能性也不大。