康熙在三次亲征当中，不计“万乘之尊”，与士兵们同甘苦、共患难的精神，“日惟一餐，恒饮浊水，甘受劳苦”，使清军士兵们非常感动，这也是三次征战清军都能获胜的原因之一。清朝时，蒙古分为漠西、漠南和漠北三部分。准噶尔是漠西蒙古的一支，自从噶尔丹统治准噶尔部以后，由于他有想要建立一个统一的蒙古国的野心，所以先后兼并了漠西及漠北。漠北蒙古有数十万人逃到漠南，请求清朝政府保护。康熙便派遣使者与噶尔丹交涉，但噶尔丹不但不退兵，反而大举进攻漠南。

　　噶尔丹生于1645年，是蒙古准噶尔部首领巴图尔浑台吉的第七个儿子。噶尔丹从小就被送去学习当喇嘛，但他喜好舞枪弄棒，却不喜欢念经。长大后，他在达赖喇嘛的支持下，回到准噶尔部落，消灭了政敌，从此，噶尔丹还俗，成为准噶尔部首领。

　　他执政之后，对四周发动多次战争，尤其对东部的喀尔喀蒙古及西边的新疆，更是屡次掠夺其居民、牲畜，侵占其牧地。喀尔喀蒙古因此多次向清朝求救，康熙曾派大臣与噶尔丹谈判，但噶尔丹都不予理睬。

　　清朝在此时无法出兵，因为国内先后有吴三桂等的三藩之乱、南蒙古察哈尔部落的纷争，对西北噶尔丹一事只好采取忍让政策。噶尔丹看清朝如此软弱，气焰更加嚣张。他不但杀害了康熙派去的使臣马迪等人，还要求康熙把女儿嫁给他为妻;甚至提出康熙“君南方”，而由他“长北方”-成立蒙古汗国的想法。

　　康熙的隐忍作风，到噶尔丹于1688年再犯喀尔喀时，终于有了转变。喀尔喀因噶尔丹入侵而向清朝求救，此时，清朝国内的政局已经稳固，各地叛乱已平，康熙于是召集群臣，决定御驾亲征。