而别所长治因为战争的失败，用自己的生命换取了家臣以及领民的姓名，在三木城中与妻子一起自杀了。所以这战争对于秀吉来说，虽然战争时候很艰苦，但最终还是胜利了，而别所长治最后逝世了，日本也失去了一位重要的大名。

天正8年正月的时候，织田信长为了实现天下统一的志向，于是便命令中国平定的总大将羽柴秀吉率兵进入播磨，并召集播磨的豪族在加谷川城的糟谷氏的屋敷评定，希望依靠豪族协助攻击中国的毛利氏。当时的豪族也纷纷积极配合，并且拟定了计划，但是由于秀吉傲慢的态度，召来了不满，最终导致协议的决裂。之后豪族都倒向了毛利方，于是就点燃了三木合战的导火线。另一个导火线便是别所方的夜袭，使其也成为了三木合战的导火线之一。这两根导火线导致了三木合战的爆发。