爱德华五世的继承是名正言顺的，理查三世在废除爱德华五世的时候选择了最为恰当的形式，就是宣布其兄长爱德华四世和伊丽莎白·伍德维尔的婚姻无效，自然爱德华五世六不具备成为国王的权利。爱德华五世被废黜之后，和弟弟理查一起被投入伦敦塔，之后两人便下落不明了，传说是理查三世派人杀害了两个孩子，但并没有证据证明。
出生于玫瑰战争年间的爱德华五世是英国约克家族主要领导人爱德华四世的长子。红白玫瑰战争是由英国金雀花王朝的两个分支，约克家族与兰开斯特家族，相互抢夺英国王位而引起的。在玫瑰战争期间，兰开斯特家族试图夺取爱德华四世的王位。在1470年，当时的英国国王爱德华四世由于盟友的背叛而被迫流亡至勃艮第。英国王位于同年10月落入兰开斯特家族的亨利六世手中。
而仍留在英国的爱德华五世的母亲为了躲避兰开斯特家族的追捕，隐居在威敏斯特教堂内，并在那里生下了他。1471年6月，他父亲重回王位后，他被封为威尔士王子，自此以后便和父母一同出席各种正式场合。1480年，爱德华四世与布列塔尼公爵弗郎索瓦二世结成同盟。他们还为自己年幼的两个孩子，10岁的爱德华和4岁的安妮缔结了婚约。这两人的第一个孩子将成为威尔士王子，第二个孩子则将拥有布列塔尼。这一承诺因为爱德华五世的悲惨命运，最终未能实现。
与爱德华五世一同遭到逮捕的还有他的弟弟约克公爵理查。自此之后，他们再也没有在公众场合露面，他们的命运成为英国历史上的数大谜团之一。无数历史书籍（如《理查三世传》）和小说（如《时间的女儿》）都谈到了这一话题。最有可能的情况是爱德华五世与其弟弟惨遭杀害，三大嫌疑凶手分别是他们的叔叔理查三世、第二代白金汉公爵亨利·斯塔福德（兰开斯特家族后裔）和后来打败理查三世登上王位的亨利七世。
一份由一位意大利教士于1483年撰写的手稿，记录了一些关于两位王室兄弟被捉拿和囚禁的状况。这位教士参与了当时的政变。理查三世先是杀掉了一位名叫威廉·黑斯廷的亲约克王朝贵族。因为他知道这个人绝对不会同意他囚禁并杀掉爱德华五世。“黑斯廷被除掉后，其他国王的亲信都不能见到国王了。”
“爱德华五世和弟弟被囚禁在伦敦塔中一个十分偏僻的房间。日子一天天过去，人们越来越少看到他们出现在铁窗和栅栏后，直到完全看不见他们。一位叫阿尔捷廷的医生可能是最后见过爱德华五世的人之一，他谈到爱德华五世每天都在用赎罪和忏悔来弥补自己的罪过。因为他坚信自己就要不久于人世。我见过许多人自爱德华被囚禁之后，每每啜泣、哀嚎。人们一直怀疑他是否被除掉。如果他真的被杀害了，我也不还不知道他是怎么被杀害的。”
1502年，理查三世手下的一名骑士詹姆士·泰瑞尔承认亲手用床垫将爱德华五世和理查憋死。然而他的说法一直让历史学家们感到怀疑。1647年，在伦敦塔工作的工人们发现了一个装有人骨的小盒子，他们先是把它扔了，后来经人提醒说这有可能是爱德华五世的遗骸才又找回来。查理二世下令将这些遗骸葬在威斯敏斯特。1933年，这些遗骸在化验后被置于他们在威斯敏特教堂内的坟墓中。专家们关于这些遗骸的年龄和性别都未能达成一致的意见。骨头非常不完整，分析起来也有一定困难。英国教会直到今天为止都拒绝对这些骨头做DNA化验。
关于理查三世是否有杀害爱德华五世的讨论至今仍在进行。理查三世最早作为杀害爱德华五世的凶手的形象来自写下《乌托邦》托马斯·莫尔的《理查三世传》。但《理查三世传》成书于都铎王朝年间，莫尔与理查三世也不是同一个年代的人。由于政治原因，书中对于前一个王朝发生的事情的描述存在故意抹黑的嫌疑。因此在史学研究中《理查三世传》的内容也经常受到质疑。世界著名推理小说《时间的女儿》也对该事件进行了推理分析，书中认为真正的凶手另有其人。虽然《时间的女儿》中的推理与分析，作为历史推理小说而言相当精彩，但其通俗读物的出身使得该书在历史研究中的参考价值较小。