明朝灭亡后，锦衣卫这个曾经权力极大的特殊组织为何消失，一直是历史学家们探究的问题。锦衣卫是明朝时期的特殊机构，由皇帝直接管理，负责皇宫内外的安全和秩序维护。而在明朝灭亡后，锦衣卫消失的原因主要有以下几个方面。

明朝灭亡后，锦衣卫的权力和地位遭到了极大的削弱。在明朝时期，锦衣卫是皇帝的亲信，可以直接接触皇帝，而且拥有很高的权力和特权。但是在明朝灭亡之后，锦衣卫失去了皇帝的宝座和特权，地位急剧下降，无法维持原有的特殊地位和权力。

明朝灭亡后，锦衣卫的组织结构和职能也发生了变化。明朝时期，锦衣卫主要负责皇宫内外的安全和秩序维护，但是在清朝时期，锦衣卫的职能被分散到各个部门，如八旗、正白旗等。同时，清朝时期的锦衣卫组织结构也发生了变化，不再是明朝时期的皇帝直接管理，而是由官方机构来管理。

锦衣卫的消失也与历史背景有关。明朝灭亡后，清朝建立，清朝封建制度下，锦衣卫这种特殊机构已经没有了存在的必要。同时，清朝时期，皇帝不再是唯一的权力来源，各个官方机构也拥有了一定的权力，锦衣卫这种特殊机构的存在已经不符合新时代的政治制度。

至于锦衣卫的去向，历史学家们的观点不尽相同。有人认为锦衣卫被清朝所吸收，成为了清朝的一部分；也有人认为，锦衣卫的成员被清朝逐渐清理，或者成为了民间的武术大师，开设武馆传授武艺。锦衣卫的消失，为中国历史的发展带来了新的一页。