文化大革命期间李莲英的坟墓遭到挖掘，一名教师被委派下去清理，结果下去打开棺材以后发现他的棺材里只有一颗头颅和一条长辫子，尸体身躯无缘却无故消失了，具体去向无从考证，但是李莲英的碑文上面介绍其尸身是完整的，最大的可能就是生前得罪人太多了才导致死后才身首异处。

　　据现存史料记载，李莲英1911年因病而终。关于他的死因，主要有三种说法，不过，经过仔细推敲，这些说法都各有漏洞。

　　李莲英旧照

　　一说，李莲英到东陵拜谒慈禧的陵寝，回来时在半路上被人杀死。

　　李据史载，李莲英死于宣统三年(1911年)二月初四。该日既不是慈禧殡天的祭日，也不是上坟祭祖的节日，李莲英却无缘无故地去东陵拜祭，就很难令人置信了。

　　二说，去山东无棣县看望侄孙女的李莲英，行到山东、河北交界处，被强人所杀，两个侍从无法运回全尸，只好带回一个人头。

　　据李氏后裔李瑞荣说：李莲英的确有侄孙女。她就是“升泰(莲英四弟)之子福春的女儿。此女名叫李丽英，她先嫁江西，后改嫁山东无棣县谢家。”但这位李的侄女久住天津，“七·七”事变后才回山东。也就是说，李莲英死时，丽英尚在天津，还未去山东。再说李莲英曾过继一个女儿，嫁在沧州知府刘洪武家。在严寒的冬季，他不看近在咫尺的女儿，却远道去看侄孙女，也未免蹊跷。