正如,对丘处机死后异象的记载,道行高深的道士和那些佛门的高僧一样,死得都非常的神奇。高僧去世叫圆寂、涅槃,而高道去世一般叫羽化、飞升或者尸解。道教最高的追求就是跳出轮回、飞升成仙。羽化,原来是指昆虫从蛹变成虫的过程,这一说法大概是来自庄子梦蝶的故事;而尸解,是因为道教认为飞仙要抛弃自己的肉体。丘处机的师傅王重阳,去世时就被称为飞升。
历史上有不少道士是因为服用丹药最后中毒身亡,但丘处机绝不是这样死的。因为丘处机所在的全真教不重炼丹,而以与外丹术相对的内丹修炼为主。所谓内丹修炼,就是不服用金石铅汞炼制而成的金丹,而是将自己的肉体当做一个鼎炉,把精气神当做药物来炼,修出体内的一颗金丹。全真教的内丹修炼是王重阳开始提出的,他认为性命是修行的根本,所以讲究性命双修。这样的修炼方式,也基本排除了丘处机服药中毒而死的可能性。