据有关资料记载，早在1887 年，孙中山就对中国首都的选择有过缜密的考虑，他曾主张“一都四京”，一都即武汉，四京即西京重庆、东京江宁、南京广州、北京顺天。可见，孙中山关于首都的第一选择，应是武昌。
1902 年，孙中山在与章太炎的一次谈话中强调说，“金陵犹不可宅。”意思就是说，南京不可做一个国家的首都。他认为，武昌扬灵于大江，东趋宝山，四日而极，足以转输矣……北望襄樊以镇抚河雄，铁道既布，而行理及于长城，其斥侯至穷朔者，金陵之绌，武昌之赢也。
除此，他还曾说过，“谋本部则武昌，谋藩服则西安，谋大洲则伊犁……”孙中山和章太炎首先考虑的定都武昌，其理由是关中、洛阳等地自然环境已经不如古代，而武昌扬灵于大江，东可控江浙，北望襄樊振抚河洛，靠着铁路交通，而北达长城，南理两粤，这是石头城的南京所达不到的。
他们还认为当年太平天国洪秀全建都南京，偏安一隅难以制远，实为失策，也是灭亡的一大原因。由此不难看出，孙中山说来说去，最中意的首都是武昌。
1911年10月10日，武昌起义爆发，各省纷纷响应，建立一个统一的临时政府已是迫在眉睫。由于武昌地处中原腹地，乃九省通衢，是辛亥革命诸次起义中第一个在省会城市取得成功的地方，况且又是孙中山的一贯主张，并得到章太炎的支持。
因此，将首都设在武昌也是顺理成章的事，多数省份都主张将中华民国临时政府的首都设在武昌，只有贵州军政府提议设在广州。已独立的各省代表到武昌后，确定在临时政府成立前，由湖北军政府代行中央政府职权，很明显，这事实上是把中央政府定在了武昌。
11月7日，湖北都督府通电全国，呈请己脱离清王朝的省份派出全权代表赴武昌设立临时政府。然而，其时清朝大军屯兵江北，虎视江南，汉阳已经失守，武昌极度吃紧，湖北军事形势极为严峻。
而当时革命党人的政治基础在东南沿海，江浙革命党人就主张将新国家的政治中心放在上海。为此，江苏都督程德全、浙江都督汤寿潜联名致电沪军都督陈其美，提议在上海设立“临时会议总机关”。
但是，就在此时，传来了江浙联军于12 月2 日攻克东南重镇南京的消息。于是，各省代表精神为之一振，两日后在武昌立即开会作出决定，将临时政府设在南京，同时决定各省代表会议也迁至南京召开。看起来，南京就要成为中华民国的第一个首都。
12月12日，各省代表会议在南京召开，筹组中华民国中央临时政府。在以同盟会委员为主的参议院“国都”问题时，又出现了南京与北京之争，主张建都北京的竟有有20人之多，而主张建都南京的只有8人。
12 月25 日孙中山从国外回来时，看到如此新形势，就放弃了将首都设在武昌的考虑，反而支持定都南京的主张。在参议院多数人投票反对定都南京之后，经孙中山、黄兴等人一再坚持和劝说，参议院复议时才确定在南京建都。
1912年1月1日，中华民国正式成立，孙中山在南京就任临时大总统。从此，南京成为中华民国政府的政治、经济和文化中心。这样，在当时的中国，就出现了两个中心并存的局面：一个是清王朝在北京的政治中心，一个是资产阶级民主革命党人在南京的政治中心。
一个月后，清帝退位、孙中山辞职，首都问题再次成为南北方争论的焦点。孙中山不再坚持首都设在武昌，而坚定地支持首都设在南京的主张。其目的在于将袁世凯调出封建专制势力强大的老巢北京，在南京可以将其控制在革命力量的监督和掌握之下。1912 年2 月13日孙中山向临时参议院提出辞职咨文，但附有三个条件。
原来，正当孙中山担任临时大总统之际，从天津小站训练新军起家的袁世凯己实际上控制了清王朝的军政大权。孙中山表示，只要袁世凯拥护共和，迫使清帝退位，结束南北对峙的局面，他自己愿意让出总统之位，请袁世凯出任临时大总统。
孙中山向袁世凯提出的三个条件，其中两条与定都南京有关：一是临时政府定都于南京，二是新总统必须到南京就职。这就是“临时政府设于南京，这是各省代表会所议定，不能更改”，并强调“新总统亲到南京受任之时，大总统及国务各员乃行辞职……”
孙中山提出这些条件，其目的是把袁世凯置于南方革命派的监控之下，确保《临时约法》的实现。
老奸巨滑的袁世凯一眼就看穿了孙中山的意图，岂肯乖乖就范?同时，袁世凯的下属北方军人集团也不愿意把中国的政治中心南移到南京。这便是当年孙中山一再要求袁世凯南下就职，而袁世凯坚决推诿、拒绝的根本原因。
袁世凯不仅不愿接受首都设在南京的决议，而且以种种卑劣的手段加以抵制。早在2 月11 日，袁世凯在致南京临时政府的电报中，就一再表示“不能南下”。2 月15 日，袁世凯即致电孙中山表示难以接受南下的要求，竟以“退归田园”这一以退为进的方法要挟。2 月21 日，临时政府派出蔡元培、汪精卫、魏宸组、宋教仁等为代表的迎袁南下就职专使团赴北京。
此时，袁世凯虽然公开表示愿赴南京就职，但是，背后却以北京各处发生的所谓兵变和各界人士纷纷反对为由，拒绝南下就职。
1912年4月2日，参议院召开会议，软弱又不成熟的革命党人作出重大让步，决定临时政府迁往北京。孙中山在南京建立政治中心的努力失败。北京政治中心的地位从1912年一直维持到1927年。
表面上仍然是强权政治，但在袁世凯死后己分裂成了皖、直、奉三大北洋军阀派系割据的状态，作为政治中心的北京己名存实亡了。