当时严嵩在朝廷里面做首辅，权力非常大，形成一个以他为首的利益集团，贪赃枉法，无恶不作，百姓被贪官搞得民不聊生，这在徐阶眼中是不能接受的，但是在当时他没有办法，在等待了长达十年之久后他等来了机会，终于将严嵩惩之于法。

之后徐阶任首辅大臣，一改严嵩当政时的风气，开始整肃官场和朝政，让当时的明朝有了很大的恢复，普通民众的生活也有所恢复，得到了人们的拥护。他当政时期将严嵩党羽一网打尽，大快人心，也得到了当时士子们的支持，对于皇帝的不当举措他也能纠正，十分有能力。

最终由于不满皇帝的一些举措，辞职归乡。但是在归乡以后他却不再正直，而是变得横行无忌，他的子弟亲属横行乡里，大肆兼并土地，导致民怨沸腾，当时的海瑞是著名清官，想要插手此事，被他行贿官员罢官调任，可谓晚节不保。