就在国内内部矛盾重重的同时，一战中美国对德国宣战，要求中国与其行动一致，在要不要紧跟美国步伐，对德国宣战这个问题上，黎、段两人的态度也不相同也使这次的战争进入白热化的阶段。几次交锋之后，黎元洪借着段祺瑞越权引众怒的机会，罢免了他的总理之位，引得段祺瑞愤然离京，但段祺瑞并没有就此认输，而是指出在《临时约法》中并没有规定总统有权能罢免总理，因此并不承认黎的免职令，准备以实力进行反扑。这场以总统和总理为首的总统府和国务院的争斗被称为“府院之争”。