但是同时新文化运动的失败不是偶然的，首先它并没有一个明确的纲领，也没有明确的组织结构，陈独秀、李大钊等人只是作为《新青年》的主编来起到一个领导的作用。同时许多知识分子都只会空谈大道理，并不能拿出任何有利于改革的有效建议。而且这场思想上的革命的范围被局限了，普通老百姓仍然不懂何为资产阶级，何为民主科学。

再说这场运动没有和群众相结合，只做思想动员，回避斗争，也没有提出明确反帝。最后对于袁世凯发起的“回归孔学”只是一味地批判，甚至全盘否定儒家文化，全盘肯定西方资产主义文化，没有正确全面地看待中国存在的问题。军阀统治时期需要的是革命而不是改革。但是同时也不可否认，新文化运动对科学自由主义甚至共产主义的传播都做出了重大的贡献。