杨乃武与小白菜剧照

知县刘锡彤因为个人恩怨对杨乃武屈打成招没有查明案件，胡乱判罪被革去了官职。而杭州知府听信刘锡彤的话，没有认真办案，而且还威胁药店掌柜做伪证，也被革去了官职。杨乃武与小白菜最后的结局是经过三年的牢狱之灾，杨乃武出狱回家与家人团聚，在杨乃武坐牢这几年，为了他的事，家里已经倾家荡产，杨乃武在亲友的帮助下赎了几亩地，潜心养蚕，以养蚕种桑为生。

杨乃武虽然经历了牢狱的苦难，但是他的正直之心并没有改变，继续帮助村民写诉状，替民伸冤。杨乃武1914年因病去世，享年74岁。杨乃武与小白菜最后的结局是小白菜出狱后没有了家人，孤苦无依陷入了迷茫，不知道该干什么、该何去何从。小白菜觉得有愧于杨乃武，对世间也再无留恋，出家当了尼姑，取名慧定。小白菜内心怀着对杨乃武的愧疚潜心向佛，过着清苦的生活。