张居正改革失败的直接原因就是，明朝的财政已经积贫积弱很久了。在嘉靖和隆庆年间已是如此，张居正的改革需要的是一个长期的过程。除此之外，明朝不仅在经济上有严重的亏损问题，军事和政治上等各个方面都是如此。明朝的官兵很多，每年老百姓要交更多的税来供养这些官兵，国家在粮食存储方面也大大不如从前。加上，明朝廷拥护张居正推行改革只有冯保和李太后，加上朝廷中，保守派的声音盖过了以张居正为首的改革派，在张居正改革的过程中，遇到了很多的阻碍，导致新政在施行过程中，难度很大。

当新政初见成效时，皇帝迫于对权贵阶层低头，中断了张居正改革，最终改革失败。