在审问了张差之后，他居然说自己是郑贵妃身边的太监引进宫中的，因此人们纷纷怀疑是郑贵妃的嫉妒心作祟，想要在杀死太子之后让自己的儿子取而代之，这种说法让朝堂和后宫都变得混乱起来，然而神宗却一味地偏宠郑贵妃，只想将这件事大事化小，于是便判定张差是个疯癫的人，因此而杀死了他，之后又在宫中秘密的将郑贵妃身边的太监杀死，这件案子就算结束了。

以上都属于梃击案的影响，然而这件事最大的影响还在于神宗的做法已经让人们觉得幕后的黑手就是郑贵妃，之后她在宫中的势力就减退了许多，而朱常洛的地位也因此变得更为稳定。