統一，才能使中國變得強大
准噶爾部是中國厄魯特蒙古族的一支。明末清初，准噶爾部貴族兼併了厄魯特蒙古各部，逐步控制了天山南北，在西起巴爾喀什湖，北越阿爾泰山，東到吐魯番，西南至吹河、塔拉斯河的中國西部邊疆地區，建立了准噶爾貴族的封建統治。
准噶爾貴族統治厄魯特蒙古各部後，與清政府仍保持著地方與中央的隸屬關係。准噶爾首領巴圖爾琿台吉、僧格等，每兩年都要向清政府遣使「朝貢」。清政府也賜予大量財物給准噶爾，並經常遣使通報情況。
但是，在准噶爾貴族內部，也有一部分人堅持分裂主義立場。1670年僧格死後，他的異母弟噶爾丹殺害了他的子嗣，奪得了准噶爾的統治權。噶爾丹是個野心勃勃的陰謀家和賣國賊，在他自任為準噶爾汗以後，1677年用計襲殺了和清政府關係最密切的厄魯特「丘爾干」（蒙語，即盟會）首領車臣汗鄂齊爾圖，強佔了河套和碩特部，並在該部強徵兵丁，準備侵犯青海地區。1678年，噶爾丹出兵南疆，佔領天山南北廣大地區，把廣大維吾爾族人民置於其統治之下。
噶爾丹取得准噶爾的統治權後，一反其父兄抗擊外來侵略、捍衛民族主權的立場，而逐漸走上與沙俄相勾結的道路。
噶爾丹在沙俄的挑唆和指使下，開始把注意力轉向東方，把矛頭指向喀爾喀蒙古地區。
1688年，正當蒙古族人民英勇抗擊戈洛文率領的沙俄侵略軍，打得俄軍丟盔卸甲、抱頭鼠竄之時，噶爾丹竟喪心病狂地突然率兵越過杭愛山，大舉進攻土謝圖汗，從背後向喀爾喀蒙古軍民施放暗箭，迫使喀爾喀蒙古諸部南遷。1690年6月，噶爾丹以為有俄國的支持，有恃無恐，以追擊喀爾喀為名，又向漠南喀爾喀蒙古進攻，俘掠人口，搶劫牲畜。他還公然向康熙帝提出「聖上君南方，我長北方」的分裂主義要求，妄圖把中國北部置於他的農奴制統治之下。
清政府為了保衛邊疆的安寧，反抗沙俄的侵略，對準噶爾部封建主噶爾丹進行了堅決的鬥爭。
清政府在外交上與沙俄侵略者展開針鋒相對的鬥爭，同時在政治上和軍事上也作了一系列準備。康熙帝認為，若聽任噶爾丹荼毒塞外，將勢成毒癰。要使邊境得以安定，國家得以長治久安，不能貪圖一時苟安之計，而必須順其民心，消滅噶爾丹叛亂分子，才能保障國內安定。因此，康熙帝決計親征。
1690年7月2日，康熙帝組成以和碩裕親王福全為撫遠大將軍和以和碩恭親王常寧為安北大將軍的左右兩路大軍，分別出古北口和喜峰日。7月14日，康熙帝也從北京啟程，24日進駐博洛河屯（今河北隆化縣），節制諸軍，統籌全局，開始了康熙帝的第一次親征。
8月1日，清軍全線出擊，大戰於烏蘭布通（今內蒙古克什克騰旗境內）。清軍大敗噶爾丹軍於烏蘭布通峰下，噶爾丹乘夜色昏暗偷渡西拉木倫河，向北潰逃。逃回科布多時，2萬軍隊僅剩數千人。
噶爾丹自烏蘭布通戰敗後，仍盤踞科布多地區，集合殘部，休養生息，以期東山再起。他一面派人去沙俄活動，企圖獲取更多的軍事支持；一面煽動內蒙古科爾沁等部作亂，並殺害清政府官員，不斷騷擾邊地安寧。
針對噶爾丹的騷擾滋事，清政府除加強軍備外，主要是展開政治攻勢，以期政治解決。
1695年5月，在沙俄的慫恿和支持下，噶爾丹率騎兵3萬向東進犯，到達巴顏烏蘭一帶，又點燃起叛亂的戰火。
1696年2月，康熙帝發兵10萬，分三路大舉出擊：東路由黑龍江將軍薩布素率東三省軍隊越興安嶺出克魯倫河進剿；西路由撫遠大將軍費揚古率陝西、甘肅兵勇由寧夏北越沙漠沿翁金河北上，以斷敵軍歸路；中路為主力，由康熙帝親率出獨石口，直奔克魯倫河，與東西兩路協同夾擊。
噶爾丹得知康熙皇帝親自統率大軍進抵克魯倫河時，不敢迎戰，盡棄廬帳、器械，乘夜西竄。清軍進抵巴顏烏蘭時，撲了個空。康熙帝為了捕捉噶爾丹叛軍主力，一面命總兵岳昇龍、馬進、白斌等率精兵輕騎窮追噶爾丹叛軍；一面密諭西路軍統帥費揚古堵截噶爾丹叛軍脫逃之路。5月13日，西路軍在昭莫多（今蒙古烏蘭巴托以南的宗莫德）與噶爾丹叛軍相遇，雙方展開了激烈鏖戰。在清軍浴血奮戰下，自午至暮，大敗噶爾丹軍，殺死叛軍3000餘人。噶爾丹的妻子阿奴也被炮彈擊斃。昭莫多一戰，基本上殲滅了噶爾丹的叛軍力量，清軍取得平叛戰爭的決定性勝利。
噶爾丹戰敗後，率殘部流竄於塔米爾河流域，成為一股走投無路、日暮途窮的流匪。但他頑固到底，拒不接受清政府的招撫，繼續堅持分裂祖國的叛亂，作最後的垂死掙扎。
為了徹底消滅噶爾丹勢力，康熙帝認為必須乘其新敗之後，搗其巢穴，以其「萬年之計」。1697年2月，康熙帝舉行第三次平叛的軍事行動，命費揚古、馬恩哈分別統率兩路大軍，共6000人，由寧夏出發，進剿噶爾丹殘部。4月，康熙帝親赴寧夏，指揮這次軍事行動。
正當清軍進發之時，噶爾丹集團內部分崩離析，眾叛親離，軍隊只剩下五六百人，噶爾丹成了孤家寡人。在清軍征剿下，噶爾丹走投無路，遂「飲藥自盡」。至此，沙俄支持下的噶爾丹的民族分裂叛亂被清政府平定下去。
噶爾丹敗死後，他的侄子策妄阿拉布坦繼續任准噶爾部台吉，准噶爾部又逐漸強大起來，和清政府發生矛盾衝突。
1715年，策妄阿拉布坦在沙俄支持下，又發動叛亂，率兵2000人竄入哈密北境，侵掠五寨。後見哈密戒備森嚴，無法佔據，又改為竄擾西藏。
清政府得知策妄阿拉布坦派兵往西藏，即令出兵圍剿。
1718年，康熙帝命皇十四子允題為撫遠大將軍，統帥大軍，駐節西寧，指揮進藏平叛的各路清軍。1720年，清軍兩路從青海和四川出發，進軍西藏，大敗准噶爾軍，大策凌敦多布狼狽而逃，率殘部逃回伊犁。
康熙帝沒有能徹底平定准噶爾貴族的叛亂就於1722年死了。他所制定的政策，由他的兒子雍正帝、孫子乾隆帝繼續推行並得到貫徹。
1727年，策妄阿拉布坦死，其子噶爾丹策零繼為準噶爾領袖。他的內外政策基本上遵循其父的路線，對東邊也沒有放棄向喀爾喀擴展的意圖。1729年，雍正帝決定發兵征討，命侍衛內大臣傅爾丹為靖邊大將軍，屯阿爾奉，出師北路；命川陝總督岳鐘琪為寧遠大將軍，屯巴裡坤，出師西路，分進合擊。噶爾丹策零聞訊驚恐，忙遣使要求清廷緩兵一年。雍正帝恩准。在緩兵期間，准噶爾出兵2萬突襲西路清軍大營，清軍損失很大，清政府與准噶爾貴族之間的關係進一步破裂。
1731年，噶爾丹策零又用詐騙計伏擊傅爾丹北路軍於和通泊，使清軍損失十分慘重。1732年6月，噶爾丹策零又派兵進犯喀爾喀，在光顯寺戰役中慘敗，只得求和。清政府與准噶爾部割據勢力之間的矛盾，暫時得到緩和，維持了將近20年的和局。
1745年，噶爾丹策零死去，策妄多爾濟那木扎爾繼位。
1750年，策妄多爾濟那木扎爾被殺，其兄喇嘛達爾扎篡位。不久，喇嘛達爾扎的堂兄弟達瓦齊聯合輝特部台吉阿睦爾撒納殺死喇嘛達爾扎，自立為汗。接著，達瓦齊又與阿睦爾撒納互相攻戰。1754年，阿睦爾撒納被達瓦齊打敗，率領2萬餘人投奔清朝。清政府認為統一西北地區的條件已經成熟，決定命將出師，消滅准噶爾貴族割據政權。
1754年，清政府決定分兵兩路遠征伊犁，平定達瓦齊割據勢力。北路以班第為定北將軍，阿睦爾撒納為定邊左副將軍；西路以陝甘總督永常為定西將軍，薩拉爾為定邊右副將軍。1755年春，清軍5萬人分西、北兩路向伊犁進軍。在准噶爾人民支持下，清軍沒有遇到抵抗，不到100天就到達伊犁。達瓦齊率兵6000人扼守伊犁西南的格登山（今新疆昭蘇縣境內），清軍以25人夜襲達瓦齊大營，達瓦齊軍驚潰，不戰自降。達瓦齊僅帶少數人倉皇南逃，為烏什城的阿奇木伯克霍集斯擒獻清軍。
在清軍捉獲達瓦齊、獲得初步平叛勝利的時候，輝特部首領阿睦爾撒納又叛變了。
阿睦爾撒納因敗於達瓦齊才歸附了清政府，欲借清政府的軍事力量消滅達瓦齊，以達到他謀取汗位的目的。1754年，清政府任命他為定邊左副將軍，率北路先鋒部隊出征達瓦齊。
1755年，他在進軍途中，廣納黨羽，收納降人，佔據地盤，企圖恢復和擴大自己的勢力。乾隆帝識破了他的詭計，密諭西路軍定邊右副將軍薩拉爾留心防範，並指示定北將軍班第，凡事宜會同商辦，切勿令其先行獨辦。阿睦爾撒納在進駐伊犁之後，便公開要求清政府封他為厄魯特四部總台吉。清政府拒絕了他的無理要求。阿睦爾撒納就在蒙古各部進行煽動，並與沙俄暗中勾結，公開發動叛亂。
1756年，清政府得知阿睦爾撒納率眾叛亂時，當機立斷，命策楞為定西將軍，玉保、富德、達勒當阿為參贊大臣，從巴裡坤出兵進討。但策楞和玉保中了阿睦爾撒納的緩兵之計，沒有窮追，讓其逃入哈薩克。
1757年初，清政府開始新的軍事行動，命成袞扎布為定邊將軍，兆惠為定邊右副將軍，率清軍7000人分兩路推進。
准噶爾叛軍在清軍的追剿下，全線潰敗。阿睦爾撒納乘夜帶隨身侍從8人投奔沙俄，不久因患天花病死異域。
1759年8月，清軍抵達喀什噶爾，平定了支持阿睦爾撒納作亂的大和卓波羅尼都和小和卓霍集占兄弟的叛亂。這年秋天，天山南路完全平定，結束了西北地區長期以來的分裂局面。
清政府平定准噶爾貴族叛亂，消除了西部邊疆的分裂割據狀況，加強了對西部邊疆地區的管理，進一步促進了全國的統一。平叛之後，廢除了准噶爾遊牧封建貴族所實行的農奴制統治，促進了西部邊疆地區社會經濟的發展。清政府平定准噶爾貴族叛亂的勝利，對侵略成性的沙俄也是一個沉重打擊，客觀上起到了維護國家統一和領土完整的積極作用。