关于成吉思汗之谜还有一点就是他的“密葬”之谜。曾经有美国考古队来到了外蒙古，他们声称已经找到了成吉思汗埋葬的地点。这支美国考古队获得了外蒙古政府的许可，在位于乌兰巴托两百多公里的地方，开始了成吉思汗墓的发掘。在挖掘过程中，这支考古队遭遇了很多神奇古怪的事情，他们发现有一条长达2英里的墙壁保护成吉思汗墓，正在挖掘之时，突然墙壁出现了很多毒蛇，一些考古队员并不被咬伤，除此之外，考古队停靠在山边的车辆也莫名其妙的滑落。当时，外蒙古的总理指责考古队的做法会亵渎蒙古祖先的安息之地，谴责他们这一做法。随后，这支美国考古队便停止了这场发掘工作。

据说，当年用了一大批士兵修建了成吉思汗墓，竣工后，他们将成吉思汗埋葬了进去。完成之后，负责这项工程的首领，将参与修建成吉思汗墓的士兵都杀光了，因为担心他们会泄露成吉思汗埋葬之处的秘密。

至今，成吉思汗墓地在哪里，仍是一个未解之谜。