在位晚期，朱见深则失去了明君作风，他重用宦官，设立了西厂，实行恐怖的特务统治，以致奸佞当道，群臣呐呐不敢言。这也是朱见深留于历史的污点。

明宪宗朱见深专宠于万贵妃，这在历史上是很有名的事情，之所以会如此宠爱她，其中有包括二人是日久生情，而万贵妃不仅拥有天仙般的美貌，同时她的性格也是很有特点的。在感情上，朱见深是专情的，在政治上他也做出了很多良好的政策，但也有缺陷之处。总的来说，朱见深是个可圈可点的皇帝。