之后，李治和武则天慢慢出现了矛盾，武则天有意掌管朝政，而李治也无力压制。后来因为李治换头痛病，更不能操持政务，所以一切都由武则天打理。武则天后来建议使用天皇天后称号，他俩并称二圣。

因为有武则天的存在，使得唐高宗李治在历史上成为了一个很独特的皇帝，他们甚至一起来治理朝政。而李治的儿子虽然没有几个，但基本上每个人都当过太子、皇帝，是唐朝历史上比较混乱的时期。