但是杨秀清随着权利的逐步增大，变得越来越飞扬跋扈，对诸王都不太尊重，一旦是犯错甚至是对诸王施行杖责，韦昌辉就曾经受到杨秀清的杖责，鉴于对杨秀清权利的忌惮，韦昌辉对杨秀清是敢怒不敢言，表面上顺从杨秀清，但是心里却是非常的不满，甚至可以说愤恨。据说杨秀清的妾的哥哥曾经与韦昌辉的哥哥因为争夺房产发生矛盾，杨秀清想要杀死韦昌辉的哥哥，于是将其交给韦昌辉处理，韦昌辉于是将自己的哥哥五马分尸，我想即使是被迫按照杨秀清的意思做了，韦昌辉心里怎么能不恨？

杨秀清的权力欲越来越大，1856年8月，杨秀清借口“天父下凡附身”让天王洪秀全到自己的东王府，并且要洪秀全封自己为万岁，洪秀全与杨秀清的权利之争可以说已经达到了白热化，洪秀全表面上应允，暗中却给韦昌辉密诏，让其回京勤王，于是韦昌辉在9月2日凌晨来到了天京并且包围了杨秀清的府邸，大喊着奉旨剿杀杨秀清，杨秀清猝不及防，被杀死，韦昌辉将杨秀清府中的所有人都尽数杀死。并且还在天京城内剿杀杨秀清的部将与亲信，天京城内血流成河。因为韦昌辉杀人太多，天京军民非常不满，再加上这个时候石达开回京靖难，大军压境，洪秀全不得已杀死了韦昌辉。这就是历史上的“天京事变”。