但是谋反的事情败露，有人暗中告密，唐太宗这次确定了侯君集的谋反之意，但还是认为罪不当死，想要对他网开一面，但是群臣认为要用国法处置这个危害国家存在的家伙，难道他把陛下您的恩情全忘了吗，是谁让他有现在的高官厚禄，是谁重用他这个斗大的字不识一个的家伙的。

唐太宗没办法否决群臣的意见，唐太宗只能决定与侯君集诀别，李世民亲自审问，说侯君集对国家有功劳，我不忍心让他死，因为他和我一起为大唐而奋斗，可以说你们之所以有今天的辉煌，很大程度上要依赖侯君集在前线的作战。但是无奈大臣都认为应该处死侯君集。

唐太宗说看来我以后只能看着侯公的遗像来追忆我们的过去了，含泪下令杀了侯君集，侯君集上刑场的时候，面不改色。对刽子手说，我是想要造反吗？我和陛下打下的天下，要我去毁灭他吗，只是我运气不好。你帮我告诉陛下，请他念在我有功于朝廷，不要加害我的孩子和夫人。

李世民听了，感慨万千，将他的妻子和儿子流放到五岭之外，免得受朝廷的干扰。