只是当时的秦二世胡亥，已经完全成为了赵高的傀儡皇帝，秦朝廷上几乎是赵高一言堂的天下，赵高想要李斯死，又怎么会轻易放过他呢？所以，在被杖责了近千棍之后，李斯终于忍不住屈打成招，被株连三族。

不过李斯也并不是如他自己所说的用心为秦，早在秦始皇驾崩的时候，赵高便找上他，为他分析胡亥登基和扶苏登基对李斯的区别。公子扶苏一向重用蒙恬，如果扶苏登基，势必会影响李斯的丞相之位，而胡亥登基就不同了，李斯就是胡亥登基的功臣，自然会记他一功，保证他的地位。

在利弊权衡之间，李斯选择和赵高同流合污，伪造诏书赐死公子扶苏和将军蒙恬，甚至在百官反对的时候，以丞相的身份镇压，给胡亥登基带来很大的便利。

不过在他与赵高合谋的时候没有想到，赵高的野心很大，大到不可能容的下李斯在一旁制衡，所以他的死是早就注定了的。