时间的推移到秦琼的儿子秦怀道的墓志铭的发现，人们进一步的了解了秦琼及他后人，但是秦怀道的墓志铭上并没有直接指出他的父亲就是秦琼，所以这份墓志铭是否真的跟秦琼有关还有待进一步的考证。

最终人们在秦佾的墓志铭中找到了答案，据秦佾的墓志铭记载，他的祖父是秦叔宝，也就是秦琼，叔宝是他的字。父亲是秦怀道，也就是我们之前提到的那位，他是秦琼晚年的幼子。其另有一子名为秦某道，因墓志铭缺字现已无从考证，只知道他曾担任右卫左郎将，有一个儿子叫做秦利见，是许州鄢陵的县丞。

以上均有史料作为考证，那么现今他的后代又在哪里呢？关于这个问题也是众说纷纭。毕竟可以考据的历史资料太少。河南卫视曾经有一档节目是“知根知底”，就是找那些历史名人的后人来上节目证明自己的身份，秦琼的后人有出现在这个节目上，但是并没有得到大家的认同。也有一说是秦琼的后代现在在山东省济南市章丘，有家谱可查，这一说法也没有得到普遍的认同。所以，关于秦琼后人还有待历史的进一步考证。