在孔尚任的而立之年，他的人生转折出现了。1684年，康熙南巡曲阜祭孔。孔尚任御前讲经，丝丝入扣，深入人心。他还巧解了康熙“拜师不拜王”的尴尬，颇得康熙的赏识，被授予国子监博士，从而进京赴官。从此，孔尚任便怀着儒家的政治思想，真正走上了仕途。孔尚任还写了一篇《出山异数记》，以表对康熙皇帝垂青的感谢。

此后，孔尚任的戏曲创作作品层出不穷，在民间流传甚广，有着深远的现实意义和艺术意义，为我国古代戏曲事业的发展做出了巨大的贡献。

孔尚任在官场，免不了牵扯进尔虞我诈的纷争。孔尚任因《桃花扇》的内容牵扯进了清朝“疑案”。孔尚任郁郁寡欢，辞官回乡。虽辞官在家，孔尚任依旧心系朝廷，在倾尽心血，终成《桃花扇》的九个月后，与世长辞。