段正淳武功绝学主要就是段家剑和一阳指。段家剑力求剑招稳妥,脚步沉稳,剑走轻灵,剑法大开大合,每一招攻守都不失法度,在轻灵飘逸的剑招之中不失王者风范;而一阳指是大理段氏的独门绝学,运功之后用右手的食指点穴,可快可慢,快如闪电,慢时也是潇洒飘逸,但是在着指之处是丝毫不差的,是克敌保身的妙术。
而说到段正淳的武功如何,可以从几个情节当中来看。段正淳在小镜湖找到自己的女儿阿紫,后来他的家臣褚万里战死,段正淳与“四大恶人”之首外号叫做“恶贯满盈”的段延庆交手。刚开始两人都使出了段家剑,但是段延庆很强悍,段正淳不敌,使出一阳指,但是仍不敌段延庆,若不是乔峰出手阻止,段正淳就死在段延庆的手里了。再一段就是在少室山,段誉被慕容复所控制,为了救儿子,段正淳使出了一阳指与慕容复交战,但是被遭到了慕容复的掌力重创。
段正淳武功在小说当中所描绘的这些人物里算不上绝顶高手,但是也可以算得上是高手了。他在小镜湖与段延庆交手的时候虽不敌段延庆,但也接了他60多招加上9下重掌,实力和丐帮徐长老、谭公谭婆、苏星河等人的武功相当。