小说里面讲，有一天全真教的门人们在观里的地道里发现一个孩子，当时已经夜深，他们发现孩子是一个女婴，而且非常小，都在讨论到底该怎么处理这个孩子，这时候孙婆婆忽然就来了，说这个孩子我去抚养吧，大家觉得交给她可以，也就让她带了孩子去了。

那么来分析这段话，什么样的女孩子会被半夜扔在门禁森严的道观里呢？为什么孙婆婆会在半夜听见孩子的哭声呢？为什么她会主动要收养这个孩子呢？先说第一个，能进得去这样的道观的，一定都是武功高强的人，半夜把孩子放在这个不是孤儿院就是和孩子的父母有关系的地方，希望孩子得到照顾，那么孩子应该是和全真教的人有关系。再说孙婆婆距离非常远，一定听不到这么隐蔽地方的孩子哭声，一定是特意为之。后来丘处机一个脾气急躁之人，为什么见了小龙女就为其作诗，在小龙女和杨过上山时又百般的庇护二人，不让教中人伤她。这个和丘处机的行事完全不符。

因此推究小龙女的身世，有人怀疑小龙女是林朝英婢女所生，孩子的父亲是丘处机，丘处机所处龙门派所以将龙纹玉作为纪念。

也有人说是朝廷里的皇嗣，所以才敢带龙纹玉。但是小龙女身世究竟是怎么回事，恐怕只有金庸心里最清楚了。