汉光武帝对冯异的评价，也给予其高度的肯定，说冯异对于国家的恩德，在名义我和他是君臣，但在恩义上，却像父子一样。由此可见，冯异对于东汉帝国的再造，有着莫大的功勋。

唐代的文士张仲宣说，东汉的云台二十八将，照映了天上的二十八星宿，这些人有的满腹经纶，有的勇武异常，都是文可安邦，武可定国的人。比如邓禹，能出奇谋而战胜敌人，比如吴汉，对镇守边关很有一套，但是相比之下，冯异的功劳却在这些人之上。

现代的史学家白寿彝也评论冯异说，冯异文武兼备，不仅战功卓越，位列云台二十八的前茅，而且在政治治理方面也很有一套，且为人谦虚，实在是一个难得的人才。