从阿拉伯的阿拔斯王朝第十任哈里发开始，就进入到了后期阶段。虽说这个阶段长达4个世纪之久，但还是被阿拉伯的史学家认为这是一个“分崩离析，衰落败退”的时代。国家的政权先后被突厥人、布韦希人热以及塞尔柱人所控制。公元861年，突厥人设计谋杀了第十任哈里发，从此就掌控了阿拔斯王朝的朝政，他们可以随意的更迭哈里发，随意任免政府官员，哈里发的权利被剥夺带劲，仅仅只是保留了宗教领袖的头衔，只在接待外国使节的时候稍稍发挥着一些作用。阿拔斯王朝的王权名存实亡，在阿拔斯王朝后期实现了实际上的政教分离。

1136年，穆克塔菲接任哈里发，塞尔柱素丹麦斯欧迪发出预言：在穆克塔菲时期将有大事发生。1141年麦斯欧迪素丹和哈里发穆克塔菲发生军事冲突，包围了巴格达但久攻不下，只好退回自己的故乡，这表明塞尔柱人对阿拔斯王朝的把持也到了强弩之末。1150年麦斯欧迪素丹死去，其王室成员贪图享乐，纵淫酗酒，不务正业，塞尔柱人从此衰落，后分裂成诸多小王国，其中影响较大的是花拉子模王国。

关于花拉子模王国的崛起，史料称，在哈里发穆斯塔兑厄时期(1170～1180)，阿拉丁(又译“阿来厄丁”(1172～1200)带领其族群占领了花拉子模，击败了塞尔柱人，在阿姆河上游至伊拉克地区建立了一个独立王国，自称“花拉子模沙赫”(意为“花拉子模国王”)。阿拉丁归真后，其子古特白继位，他要求哈里发下令取消在全国的清真寺里颂扬塞尔柱君王的名字，改用他的名字，遭到拒绝。于是，古特白在他自己的势力范围内亦不提哈里发的名字。古特白的统治一直维持到蒙古人入侵(1220年)，其后由贾来勒丁执政。1231年，花拉子模王国被蒙古人消灭。

花拉子模王国被蒙古人消灭与阿拔斯王朝有关。因为塞尔柱人退出政治舞台后，哈里发纳赛尔感受到了来自花拉子模人的威胁，于是派出使者求助于鞑靼人(即蒙古人)，请他们从背后牵制花拉子模人，消解花拉子模人的军事压力。依靠他人的力量来解救自己，对阿拔斯朝的哈里发来说，已有多次经验，突厥人、布韦希人、塞尔柱人、花拉子模人都是他们请来的，得到的结果几乎相同：前门驱狼，后门进虎。

1215年，成吉思汗派使臣出使花拉子模王国，献上大量的珍贵礼品，要求和花拉子模王国缔结和约，得到了花拉子模国君的应允。从此，两国商人开始互往，蒙古人的视线由此转向了伊斯兰世界。

不久，蒙古人撕毁和约，将他们的铁骑开进了伊斯兰世界。他们先后征服了布哈拉、撒马尔汗、拉伊、尼斯布尔、哈马丹、阿塞拜疆、加尔疆、大亚美尼亚等地，足迹最远踏至欧洲。

阿拔斯朝的末任哈里发是穆斯塔阿绥姆。1257年9月，成吉思汗之孙旭烈兀攻到哈马丹，向巴格达城里的哈里发传书，言称若不投降，玉石俱焚。在这危急关头，胸无大志的穆斯塔阿绥姆依然荒怠朝政，贪图享乐。两个月后，旭烈兀在众多穆斯林首领的陪同下，开向巴格达，1258年1月在巴格达城东扎下大营。几经磋商，穆斯塔阿绥姆决定开城揖降。1258年2月，旭烈兀率3万骑兵涌进巴格达，把穆斯塔阿绥姆等押在大营中，自己住进了巴格达东部的麦蒙宫。蒙古人入城后，到处杀人放火，整个城市被洗劫一空，清真寺、陵墓遭到严重破坏，这一历史悲剧至穆斯塔阿绥姆及其子嗣全部被处死而宣告结束。

历时5个多世纪的阿拔斯王朝终于宣告灭亡，富丽堂皇的巴格达毁于一旦。阿拔斯朝的崩溃，结束了传统的哈里发制度，代之而起的是群雄争霸的局面，各地埃米尔各据一方，开始自称哈里发。

哈里发穆斯塔阿绥姆被害后，众穆民起先都以为伊斯兰世界不可一日没有哈里发，但他们很快就接受了事实，即没有哈里发，而由各地埃米尔自治的局面同样是合理的。

阿拔斯朝后期哈里发

10.穆塔瓦基勒 847～861

11.蒙塔绥尔 861～862

12.穆斯塔伊努 862～866

13.穆阿塔兹 　 866～869

14.穆赫塔迪 869～870

15.穆阿塔米德 　　870～892

16.穆阿塔迪德 　 892～902

17.穆克塔菲 　 902～908

18.穆格塔迪尔 908～932

19.高希尔 932～934

20.拉迪 　　 934～940

21.穆塔基 940～944

22.穆斯塔克菲 944～946

23.穆兑阿 　 946～974

24.塔伊阿 974～991

25.高迪尔 991～1031

26.高伊姆 1031～1075

27.穆高塔迪 　　1075～1094

28.穆斯塔兹海尔　 1094～1118

29.穆斯塔尔西德　 1118～1135

30.拉西杜 1135～1136

31.穆格塔菲 1136～1160

32.穆斯坦吉德 1160～1170

33.穆斯塔兑厄 1170～1180

34.纳绥尔 1180～1225

35.昭海尔 1225～1226

36.穆斯坦绥尔 1226～1242

37.穆斯塔阿绥姆 1242～1258