公元前1500年，来自乌拉尔──伏尔加河的印欧族雅利安人东迁到中亚和伊朗高原，其中定居在伊朗高原的居民是波斯人的祖先，定居在中亚的雅利安人是中亚塞种人的祖先，他们都操波斯语。公元前558年波斯国建立，并逐步建立起一个统治小亚、埃及、印度河的帝国，并占领了中亚。

公元前324年，马其顿──希腊人灭亡波斯帝国，中亚成为塞琉古王国的一部分。前250年，塔吉克-阿富汗脱离塞琉古王国独立，建立希腊人的大夏王国；三年后，波斯人脱离塞琉古建立波斯人的安息王国。

前140年，来自天山的塞种人灭掉希腊人，解放了当地的塞种同胞。“螳螂捕蝉，黄雀在后”，月氏人进入这里，灭掉大夏，建立了月氏人的统治，逐渐建立一个强大的贵霜帝国。受月氏人压迫，当地塞人和天山塞人的一部分南迁到印度河。乌孙、康居、栗特、大宛是当时并存的几个大的塞种人国家。公元91年，在汉帝国的帮助下，摆脱匈奴控制，并将匈奴人从中亚赶到乌拉尔河的阿兰人所在地。公元前后的两个世纪中亚是汉帝国、月氏和匈奴的天下。

公元375年厌达南迁到栗特，进而灭掉贵霜帝国，击败萨珊朝波斯，占领印度，建立强大的厌达国。公元420年，鲜卑族的一支柔然强大起来，控制中亚，并驱赶阿兰地的匈奴人，匈奴人干脆把阿兰灭掉，向西进攻哥特部日尔曼人。五世纪，中亚为厌达-柔然二国演义。

公元552年，突厥灭掉柔然，柔然分两支逃匿：一支跑到额尔古纳河，为室韦；一支跑到辽河上游为契丹。公元567年突厥联合萨珊朝波斯灭掉厌达。整个中亚变成了突厥人的天下，更重要的是，突厥人显示了在文化上的优势，同化了（除了塔吉克和阿富汗之外）所有的原中亚塞种人。

公元639年，突厥被唐帝国灭掉，后来整个中亚变成了阿拉伯-唐-吐蕃三国轮流坐庄的大舞台。但中亚人已经突厥化100年，而没有进一步汉化、阿拉伯化或藏化。公元870年，突厥人的一支回鹘人在蒙古高原建立的回鹘汗国被黠戛斯灭掉，他们被迫迁到中亚，建立了喀喇汗、高昌两个回鹘国家；波斯人脱离阿拉伯帝国独立，建立波斯萨玛尼王朝。公元962年，强大的波斯哥疾宁王朝灭掉萨玛尼王朝，控制伊朗、阿富汗、塔吉克和印度河。

1037年，塞尔柱突厥人灭掉哥疾宁王朝，控制阿拉伯哈里发，进攻东罗马，并占领耶路撒冷，与十字军战斗。十一世纪，整个中亚又重新成为突厥的天下，北部为维吾尔喀喇汗王朝、南部为塞尔柱突厥王朝。

1125年，喀喇汗、高昌回鹘被契丹人灭掉，中亚成了契丹人西辽帝国的天下，1194年突厥人的花剌子模占领河中、伊朗，成为中亚大国，但实力弱于西辽，被迫向西辽称臣。1226年，蒙古灭掉西辽和花剌子模，中亚成为蒙古帝国的察合台汗国。

1348年东西察合台分裂，1369年，蒙古帖木尔帝国取代西察合台汗国，并脱离东察合台汗国，先后占领蒙古伊尔汗国、印度河和蒙古钦察汗国，成了巨大无比的蒙古第二帝国。1406年蒙古帖木尔帝国分裂，（1）伊朗脱离帖木尔独立；（2）蒙古钦察汗国脱离帖木尔独立，1480年败于俄罗斯后钦察又分裂为西伯利亚、喀山、克里米亚等汗国，1550年先后被俄罗斯灭亡，汗国的蒙古人也同化融合于俄罗斯人；（3）奥斯曼土耳其脱离帖木尔独立并于1453年灭掉东罗马，成为跨欧亚非的大帝国；（4）1456年哈萨克汗国成立，但1589年分裂为三个玉兹，境内的蒙古人也同化融合于哈萨克族；（5）最终帖木尔在1500年被乌兹别克汗国灭掉，其后代侵入印度建立蒙古莫卧尔帝国，乌兹别克和印度境内的蒙古人也逐渐融入当地民族。

1514年东察合台满速尔汗的三弟赛伊德推翻蒙古族杜格拉特部在天山南路的统治，建立叶尔羌汗国。蒙古族杜格拉特部和蒙古察合台皇室后裔赛伊德都已经突厥化，失去本民族特征，融入维吾尔族。1540年蒙古北元帝国的瓦剌部侵入北疆，1543年东察合台可汗沙袭击瓦剌战死，叶尔羌汗国趁机灭掉东察合台汗国。叶尔羌汗国第三代汗阿不都克里木执政时，为了加强自己的统治地位，把和卓伊斯哈克·瓦力（维吾尔族人）从中亚地区请到叶尔羌，伊斯哈克家族逐渐成为左右叶尔羌汗国政局的一大势力。后来伊斯哈克同父异母的哥哥的两个儿子（尤素甫与阿帕克和卓）来到了喀什噶尔，形成一个新的宗教派别。热西德汗之孙阿布杜拉汗统治的后期，将其长子尧勒瓦斯排挤出统治集团核心，派往喀什噶尔出任总督。以伊斯哈克·瓦力家族为代表的一派，称为“咨脚伞保灰杂人馗?桶⑴量撕妥啃值芪??淼囊慌桑?莆?昂谏脚伞薄：谏脚捎?665年协助尧勒瓦斯夺得了大汗之位。

1678年黑山派首领带领北疆准噶尔蒙古汗国军队消灭了叶尔羌汗国，建立了政教合一的第一个“霍加政权”，控制了天山以南的地区。1715年，这位黑山派首领的孙子艾合买提当国王，可不知道为什么却成了白山派人物。准噶尔讨厌白山派，消灭了他，扶植原黑山派首领后裔尤素甫接手统治。尤素甫建立了以黑山派为主要势力的第二个“霍加政权”。1755年，艾合买提汗的两个儿子波罗尼都与霍集占（史称“大小和卓”）消灭了尤素甫的“黑山派”政权，白山派势力再度得势。

1543年蒙古瓦剌分裂为准噶尔、和硕特、土尔扈特、杜尔伯特四部。后来准噶尔部强大起来，和硕特被迫迁到青海和西藏，土尔扈特被迫迁到前钦察首都萨莱（阿斯特拉罕），杜尔伯特也屈服于准噶尔。1678年准噶尔灭亡准噶尔汗国。哈萨克大中玉兹也臣服于准噶尔，小玉兹臣服于俄罗斯。后来准噶尔干脆灭掉和硕特汗国，统治西藏。这时整个中亚的形势是：准噶尔独霸天下，俄罗斯伺机而动。1720年清军击败准噶尔，占领西藏，1724年清军占领青海。1757年清军攻占北疆，对准噶尔实行种族灭绝政策，1759年清军扑灭叶尔羌汗国残余势力维吾尔族大小和卓，平定南疆，设伊犁将军，管辖天山南北。此后一个世纪，中亚变成了清朝和俄罗斯的天下。

1885年，俄罗斯吞并哈萨克、乌兹别克等整个中亚，清军固守新疆，直到1990年，中亚是俄罗斯称霸，中国退守。

1900年中亚五国脱离俄罗斯独立，中国在新疆的防守才得以根本改观，并积极参与中亚的石油开发计划。同时，塔吉克、阿富汗属于塞种人，说东伊朗语（波斯语），成了伊朗争夺的对象；突厥国家吉尔吉斯、哈萨克、乌兹别克、土库曼成了突厥领袖土耳其的文化势力范围。