另外张格尔之乱的影响还在于让清朝付出了许多的精力，其实那个时期清朝这个国家屡次经历内忧外患，国力已经大不如从前，张格尔作乱时期清朝将伊犁等地区的军队都集合起来，甚至还从东北地区调动了兵马，而且在征讨叛军的时候还要付出更多的粮草，这些虽然不能伤害到清朝的根本，但是对今后的发展也是不利的。