如果坚持和平的做法是在明处，那么中国方面在暗处对印尼排华事件做出的抗议或是报复就很多了。在马六甲海峡中国以自卫为缘由，扶植泰国、缅甸等发展海军，并且建立了空军和海军地基，由此遏制了印尼在马六甲海峡的军事发展。 1999年中国海军曾经南下增加兵力援助泰国攀牙，名义是接受泰国方面的邀请，其实际目的则是用武力威慑印尼海军。当然之后还有一系列的事件，使得印尼于2003年与中国签订了相关协定，将当年与印尼排华事件相关的军队、警察等涉案人员进行了秘密抓捕，由此面对印尼排华事件中国报复才得以停止。