但也有人说，此次的失败是日军前期的准备不足，并不是南云忠一的责任，他只是替罪羊。圣克鲁斯战役中，他最后移交指挥权给部下被人认为是临阵脱逃，但也有人认为南云忠一是迫不得已才撤离翔鹤号。之后宇垣缠承认是南云忠一的正确决策使得航空母舰能完整的保留下来。有人在客观的对南云忠一评价中称：南云忠一也许不是指挥大型航母的完美人选，但是在战争初期，他作为航母军队的最高指挥官是功不可没的。