朱翊钧的墓先后经历过三次比较大的损坏，现在地上部分能够进行修缮的已经全部完成了，破坏也并不是十分严重，而地下部分的建筑虽然没有受到什么损坏，但是出土的文物因为当时的保护工作不到位，所以遭到损坏的比较多。