在三藩之乱开始初期，清朝廷只是调集了7万军队。这些军队，包括满洲八旗、科尔沁、察哈尔等地的兵马。因为当时的清廷还不知道八旗军的战斗力已经下降，因此对于吴三桂的叛乱并没有太大的重视，最终导致了三藩之乱前期的失败。清廷不知道，吴三桂在长沙、萍乡等地这些地方，就有7.3万军队。吴三桂手下的将领王屏藩进攻丙北的汉军就有2万人以上，足见吴三桂兵力的可怕。不止如此，当陕西提督王辅臣反叛清朝以后，吴三桂的实力就更加的强大。吴三桂只是三藩中的一番，实际兵力已经超过了十万。

三藩之二的耿精忠手下有15万军队，包括程风手下7万和郭应辅手下的8万人；尚之信手下也有10万人以上。因此，三藩之乱三藩兵力已经达到了35万以上。清政府在战争初期遭受到了很大的损失。

虽然清政府当时在全国有四十五万军队，但是由于中国太大，再除去保护京城的11万人，能作战的部队也只有30万左右。这三十万，分散在全国各地。实际参加叛乱的清军，只有15万左右。这样悬殊的兵力对比，清军却赢得了最后的胜利。

通过对三藩之乱兵力的研究，可以看出，即使三藩占据了兵力上的优势，但是若没有人民的支持，最终还是会失败。