埃及人其后对美吉多城进行了长时间的包围，并且在美吉多城的四周挖了护城河。美吉多城中的迦南联军最终选择了投降。埃及人攻占美吉多城以后，得到了大量的物资。他们得到了2041匹战马，得到了894辆战车，其中两辆是用金子装饰的。另外还有200副盔甲，其中有两副是卡叠石国王和美吉多国王的铜铠甲。

埃及在古美吉多战役的结果中得益最大的是政治方面，埃及打赢了古美吉多战役，使得迦南联军不敢再反叛埃及。埃及攻占美吉多城以后，又攻占了地中海东海岸的土地。埃及的海军从埃及本土到地中海东海岸只需要三四天的时间。

埃及取得美吉多战役的胜利结果与埃及国家的强大有关。当时的埃及在图特摩斯三世的领导下，内政清明，农业发展很快。在国外，埃及军队越过西奈半岛，进入中东地区，参与这个地区的争霸。