新几内亚两军的动用的兵力也不相上下。日军方面为陆军第8方面军属下的第18军和第4航空军，由今村均大将为司令。还有海军东南方面舰队的第9舰队；驻新几内亚西部地区的日军为第2方面军。盟军方面参战的部队有美国陆军第6集团军包括管辖下的第24、第32、第41师；澳大利亚陆军司令布莱梅管辖下的第3、第5、第7、第9师；美国海军的第3舰队、第38特混舰队、乔治·丘吉尔·肯尼指挥下的美国陆军第5航空队，盟军的总指挥为道格拉斯·麦克阿瑟。

1943年6月3日，美澳盟军开始登陆拿骚湾，随后攻击日军，8月17日空袭了日军机场，几乎将日军的飞机全部击毁，夺得了制空权。在美澳盟军的不段进攻下，最终在1944年的7月30日登陆桑萨波尔，新几内亚战役结束。