这座纪念馆是为了纪念1928年5月3日，侵华日军在济南制造的、震惊世界的五三惨案。为了抵抗侵华日军的暴行，赴任不到一天的、任国民政府山东交涉署交涉员的蔡公时先生壮烈殉国。1930年，陈嘉庚先生代表众位爱国华侨们捐筑了蔡公时烈士的铜像，但是由于当时国内抗战，铜像被放置在新加坡纪念孙中山先生的别墅园里。2006年4月18日，经过许多人的不懈努力，蔡公时的铜像终于抵达济南，回到了泉城。

铜像回归后，济南方面立即决心建立一座纪念馆，经过一年的努力，于2007年4月28日，济南惨案纪念馆终于落成。从此蔡公时先生的铜像在济南扎根，每天有200万的客流量前来纪念先辈、铭记国耻，也是当时建造纪念馆的初心所在。