清军押解张格尔图片

张格尔之乱的影响可以从一下几点来说明，首先这次叛乱打破了从前新疆地区稳定发展的局势，从这开始之后的和卓之乱等战乱开始不断的发生。自从乾隆统一了整个新疆之后，六十几年来一直保持着平稳发展的局势。政治上也是比较安稳的，没有什么大的事情发生。张格尔之乱让喀什葛尔等四个地区沦陷，并且许多清朝官员都在战争中丧命牺牲。而且这四个地区也是饱受张格尔的摧残。在此之前新疆地区的人民休养生息，经济上发展的比较富裕，可是张格尔作乱之后屡次抢夺百姓的财产，并且屠杀平民，让当地百姓受尽了苦楚。

另外张格尔之乱的影响还在于让清朝付出了许多的精力，其实那个时期清朝这个国家屡次经历内忧外患，国力已经大不如从前，张格尔作乱时期清朝将伊犁等地区的军队都集合起来，甚至还从东北地区调动了兵马，而且在征讨叛军的时候还要付出更多的粮草，这些虽然不能伤害到清朝的根本，但是对今后的发展也是不利的。