在12天的空降过程中，盟军在德军的打击下，所付出的代价也不小。英军损失15743人，其中牺牲亡1742人。海上力量的3艘巡洋舰，6艘驱逐舰和其他各类军舰29艘被德军所击沉，也包括一艘航空母舰，海军伤亡也达2000多人。英国人员伤亡总计1.8万人。与此同时希腊也有1.4万军队被德军歼灭，被俘达6000人。
可以这么说，克里特岛战役，德英双方，都付出了惨痛的代价。最终德军占领了克里特岛。使德国东南欧的陆上交通线生命线得到了有利保障，也控制了爱琴海区域和地中海东部地区航线，并使欧洲海上霸主英国丧失了地中海内最重要的据点。在第二战争开辟之前，德国在东南欧方面，没有任何后顾之忧。这就是克里特岛战役结果。
克里特岛战役的评价
如果从克里特岛战役的战场效果来说，我们能对这场战役作出一些评价。
克里特岛战役战场图
首先，克里特岛战役从战略层面上来说，德军在这场战役之后，取得了主动权，为战略东移进攻苏联做好了战略准备。盟军在这场战役之后，失去了一些重要的战略地区。
但是，从战术的角度来说，克里特岛战役是德军一次惨胜。德军在这一次战役中，犯了三个战术错误。第一就是仅仅以单一兵种进行一场大规模战役的做法显然是错误的。虽然在这次战役中，德国空军和海军都有所努力，但是主要以空降兵为主的进攻，无法压制和分散敌军火力，使得德国空降兵暴露在盟军的炮火下，伤亡惨重。
第二个战术失误就是德国空降伞兵分散作战。在克里特岛战役中，德国伞兵并没有凝聚成一股力量，而是多点空降，分散了伞兵的力量。使得大部分伞兵在落地后无法有效抵抗盟军的火力而丧失战斗力。
第三个战术失误就失去了战斗的突然性。原本德国是“闪电战”的最初使用者，对闪电战的应用应该得心应手。但是在克里特岛战役中，德军并没有用这一特长，却使用了之前从来没使用过的空降作战。空降作战，无法对造成一种突然性和袭击性，这不得不说是一个指挥战术的失误。不熟练的战术，无法进行战术的协调配合，使得德军的空降兵在盟军后方孤军奋战，最终落得损失惨重的下场。
因此，克里特岛战役，不得不评价为：德军的惨胜，盟军的暂败。