其实这场战争最然以法军的胜利而告终，然而说“全歼”普鲁士部队，恐怕言过其实，须知十九世纪早期的战争，并没有现代化的远程攻击武器，也没有机枪、榴弹炮等大规模杀伤性武器，因而动辄几十万人的伤亡似乎不太可能，换言之，法军能以常规武器在正面战场击溃普鲁士军，已经是很了不起的战果了。并且，此一战导致普鲁士军队减员过半，元气大伤，主帅也身受重伤，在短时间内无力重振旗鼓，已是不争的事实，所以，没有人能否定拿破仑在这场战斗中发挥了卓越的军事指挥及战略部署能力，也对那个历史时期法军在欧洲战争的战斗力给予了充分的肯定，由此，可以推定欧洲历史文献中对本次战绩的记载，基本属实。

至于为什么说耶拿战役全歼普鲁士，只能认定为法兰西人自我吹嘘的说法。

耶拿战役结果

耶拿战役图

据欧洲历史记载，耶拿战役结果十分惨烈，在给普鲁士军队造成巨大伤亡的同时，法军亦有数千将士魂断疆场，然而战役取胜之后，好大喜功的拿破仑并没就此反省引起这场战争的外交失策，依然以凯旋归来的姿态对战争中做出巨大贡献的法军军官加官进爵，比如第三军统帅达武，他因此战而被封为奥尔斯塔特公爵，更成为帝国历史上名垂千古的著名战将。相对的，作战不利的贝尔纳多特则在回到巴黎后，遭到了拿破仑的严厉指责，继而被免职。

耶拿战役结果，对法国人来说，自然是一场欢庆，然而对战败的普鲁士人来说，无疑是一段长久的痛苦。

在战役中遭受巨大损失的普鲁士人，战后一度情绪低落，尤其是不伦瑞克公爵在战场上受到了致命伤，这意味着接下来的很长一度时间内，普鲁士人都无法对法军实施有效的反击，加之霍恩洛厄亲王与冯·吕歇尔将军所率领的数万普军又分别在10月11月投降法军，如此一来，对普鲁士的士气，更是形成不小的打击。

普鲁士的惨败，标志着第四次反法同盟与法国正面交战的失败，这意味着拿破仑统治下的法兰西第一帝国，还将纵横欧洲大陆一段较长的时日。