美坚利联盟国的旗帜则比较复杂，大致是模仿了美坚利合众国的国旗，被南方居民称为“恶俗的模仿”。大体上，联盟国和合众国的旗帜有些类似，但合众国的红白横条比较少，只有三杠。起初蓝色部分的星星有七颗，围成一个圈。后来随着战争的发展，又有一些州加入到联盟国内，因此围起来的星星变成了13颗。后来，大概是联盟国的领导人也发现自己的国旗和合众国的国旗实在太想了，在战场上不仔细看根本分辨不出来。因此又将其改成了星杠期。也就是以红色打底，两条蓝色的杠贯穿对角，形成一个十字，蓝色的杠上同样绣13颗星代表着13个州。

也许是南方有着战胜的打算，因此在国旗的设计上，并没有对合众国的旗帜有多少改动，或许是在战胜之后依然沿用星条旗吧。在如今的美国南方，一些联盟国的支持者，依然在自己的家中悬挂着联盟国的旗帜。